< Tests

Testleri gruplandırma ("havuzlama" veya havuzlama): neden ve ne için?

Metin güncellendi 2020-10-07


Havuzlama, farklı kişilerden alınan örneklerin karışımını analiz etmek için tek bir tanı testi kullanmayı içerir. Havuzlama toplu taramayı hızlandırıyor, maliyetleri düşürür ve toplumlardaki salgınları önler.

1943 yılında Amerikalı bir istatistikçi olan Robert Dorfman tarafından icat edilen grup testleri prensibi basittir: 100 numuneyi test etmek yerine, on gruptan oluşan on gruba (havuz) gruplandırılabilir ve her grup test edilebilir. Gruplardan biri pozitifse, örneklerden en az biri enfeksiyöz ajan içerir. Tersine, grup negatif ise, o zaman bunu oluşturan her örnek de negatif olması gerektiği sonucuna varılabilir (yanlış negatifler yoksa, yani bir birey Virüs ).

Testleri gruplandırmak, neden ve neden?

Yöntem, pahalı ve enerjik olması muhtemel tanı için gerekli reaktifleri kaydeder. Soruya bakın Ben enfekte olup olmadığını öğrenmek için ne bir test Korona virüsü (SARS-CoV-2) ?

Grup test stratejisi, ABD'de Şubat 2020 gibi erken bir sürede COVID-19 salgını bağlamında kullanılmıştır. San Francisco Bay Area çeşitli sitelerde yapılan, amaç viral yaygınlığı tahmin etmekoldu, coronavirus ile enfekte nüfusun fraksiyonu yani Korona virüsü (SARS-CoV-2) Nüfus.

Amerika Birleşik Devletleri'nde, ABD Hastalık Kontrol Merkezleri (CDC) şimdi havuzlama teknolojisinin kullanımı 3 türleri ayırt, bağlı olarak:

1) bireysel tanı için,

2) kitle taraması için,

3) salgın gözetim için

Biz aşağıda bu 3 kullanır tartışmak.

1) Bireysel tanılamada kullanım

Grup testinin sonucu gruptaki tüm bireyler içindir. İlk yöntem enfekte birey veya bireyleri belirlemek ve pozitif bireyler olarak tanımlanan gruplardan her bir örneği test etmektir.

Ancak, Dorfman olarak bilinen bu yöntem, yeni bir tanı döngüsü gerektirdiğinden en etkili yöntem değildir. Bu ek adım, tek tek işleme süresini önemli ölçüde artırır.

Diğer yöntemler, bireysel tanı elde etmek için örneklerin akıllıca çeşitli gruplar halinde birleştirilmesine olanak sağlar. Bunlar, matris havuzu, hypercube veya P-Best yöntemleri gibi COVID-19 salgını bağlamında uygulanmıştır. Tüm bu teknikler oranı olarak tüm daha etkilidir kişiler enfekte düşüktür. Dorfman yöntemi için, bireylerin %5'inden azı enfekte olduğunda optimal grup boyutu 5'ten büyüktür.

Havuzlama yanlış negatiflere neden olabilir bir tekniktir, unis enfekte bireylerden örneklerin havuzunda enfekte bir bireyden numunenin viral konsantrasyonseyreltilmesi nedeniyle.

2) Kitle taraması için kullanın

Test havuzu, sabit ekonomik maliyetle, bireylerin daha fazla sayıda test etmek için izin verir ve risk altındaki topluluklarda düzenli testler gerçekleştirme imkanı açılır (genellikle Ehpad veya gıda üretim merkezleri).

Almanya'da salgını önleme amacıyla hastane tesislerinin yanı sıra huzurevlerinde 5 ila 30 örnekten oluşan gruplandırma testleri yapıldı ve bu sayı 22.000'e ulaştı. kişiler 13 Mart-29 Nisan tarihleri arasında bu yapılarda test edilmiştir. Grup testlerinde yanlış negatiflerin riskleri nelerdir sorusunu görün.

3) Gözetim ve salgın önleme için kullanın

Test grubunda enfekte bireyin izini denemeden bir havuz sonucu elde etmek ilginç olabilir. Pozitif bir havuz sonucu bir uyarı yordamı ve güvenlik yordamları güçlendirilmesi tetikleyebilir.

Matematiksel modeller, zaman içinde tekrarlanan küme testlerinin salgın yayılmadan önce pre-semptomatik veya asemptomatik vakaları nasıl daha hızlı algılayabildiğini göstermektedir. Test havuzunun izleme amacıyla bu tür kullanımı atık sulara benzer.

Dünya Sağlık Örgütü semptomatik bireylerin klinik tanısı veya kontak tanıları izlemek için havuz karşı önerir, ama ABD CDC kitle tarama için ilginç havuzlama düşünüyor. Gıda ve İlaç İdaresi (FDA) 4 örneğe kadar gruplanmış virolojik testlerin kullanımı için bir yetki yi onaylamıştır.

Daha iyi kabul edilebilmesi için kullanılan numuneler tükürük örneklerinden alınabilir. Coronavirus varlığını test etmek için hangi örnek soru bakın: nazofaryngeal veya oral?

Tıbbi laboratuvarların aşırı yüklenmemesi için, Abd CDC diğer yapılara (genellikle klinik tanı için yetkili olmayan araştırma laboratuvarları gibi) sonuçların bireylere iletilmesi koşuluyla bu testleri gruplar halinde yapmalarıiçin yetki verir.


Facebook Twitter Linkedın

Kaynaklar

Mükemmel bir test durumunda en uygun boyutu gösteren tarihsel makale (havuzun büyüklüğü ile yanlış negatif riskini artırmadan).

Dorfman, R. (1943). Büyük popülasyonların kusurlu üyelerinin tespiti. Matematiksel İstatistik Yıllıkları, 14(4), 436-440.

C. Gollier ve O. Gossner'in çevrelemenin başında yayınlanan yöntemi, daha güvenli bir şekilde sınır dansı sağlamak ve işçilerin işyerlerine dönmelerine izin vermek için birlikte verilen testleri kullanmaktır.

Gollier, C., Gossner, O. (2020). Covid-19'a karşı grup testi. Covid Ekonomi, 2.

Grup testlerinin ilk kullanımı 10'ar lı gruplar halinde test edilen 2.888 nazofarenkgeal örnek üzerinde test edilmiştir. Tespit edilen üç pozitif tespit, Şubat 2020 sonlarında tespit edildi, bize California eyaletinde viral enfeksiyon ortaya çıkması tarih izin.

Hogan, C.A., Sahoo, M. K., Pinsky, B.A. (2020). Topluluk iletimini tespit etmek için bir strateji olarak örnek havuzlama Korona virüsü (SARS-CoV-2) . Jama, 323(19), 1967-1969.

ABD Hastalık Kontrol ve Önleme Merkezi'nin önerileri, tanı, tarama ve gözetim arasındaki ayrımı resmileştirmek.

Havuzlama Prosedürlerinin Kullanımına İlişkin Geçici Yönerge Korona virüsü (SARS-CoV-2) Teşhis, Tarama ve Gözetim Testleri, Hastalık Kontrol ve Önleme Merkezi. 1 Ağustos 2020.

8'li grupta Dorfman yönteminin uygulanması; Asemptomatik bireylerden 26.576 örnek, 31 (%0.12) sars-CoV2 için pozitif saptadı. Bu, test sayısında 7,3 faktörün bir kazanım anlamına gelir.

Ben-Ami, R., Klochendler, A., Seidel, M., Sido, T., Gurel-Gurevich, O., Yassour, M., ... - Gertler, A. (2020). Havuzlu RNA ekstraksiyonu ve RT-PCR'nin büyük ölçekli uygulanması Korona virüsü (SARS-CoV-2) Algılama. Klinik Mikrobiyoloji ve Enfeksiyon, 26(9), 1248-1253.

Hypercube adı verilen bir yöntemin uygulanması ve teorik tartışması.

Mutesa, L., Ndishimye, P., Butera, Y., Uwineza, A., Rutayisire, R., Musoni, E., ... - Musanabaganwa, C. (2020). Enfekte olan kişileri bulmak için bir strateji Korona virüsü (SARS-CoV-2) : havuzlu testin düşük yaygınlıkta optimize edilmesi. arXiv ön baskı arXiv:2004.14934.

Sadece 144 test kullanarak 1.115 sağlık personeli ekrankombine bir havuzlama yöntemi (P-Best) pratik uygulama.

Shental, N., Levy, S., Wuvshet, V., Skorniakov, S., Shalem, B., Ottolenghi, A., ... - Goldhirsh, M. (2020). Verimli yüksek verimli Korona virüsü (SARS-CoV-2) asemptomatik taşıyıcıları tespit etmek için test. Bilim Gelişmeler, 6(37), eabc5961.

Tükürük örneklerinde Gruplanmış testler (boyut 5-20) SalivaDirect testinin arkasında da Yale Üniversitesi ekibi tarafından yapılır.

Watkins, A. E., Fenichel, E. P., Weinberger, D.M., Vogels, C.B., Brackney, D. E., Casanovas-Massana, A., ... - Cruz, C. S. D. (2020). Tükürük havuzu artırmak için Korona virüsü (SARS-CoV-2) kapasiteyi test etmek. medRxiv.

Için kitle taraması yapılan bir çalışma Korona virüsü (SARS-CoV-2) iki kohort arasında kişiler Japonya'da asemptomatik, temas vakalarından biri (161 kişi) ve diğer bireyler havaalanlarında karantinaya (1.763 kişi). Çalışma, RT-PCR testinin nazofarenk bezleri (NP) ile genel bir duyarlılığını gösterirken, tükürük örneklerinde %92'ye karşı %86'lık bir duyarlılık göstermektedir. Her iki numunenin özgüllüğü %99,9'dan fazladır.

Yokota, I., Shane, P. Y., Okada, K., Unoki, Y., Yang, Y., Inao, T., ... Nishida, M. (2020). Asemptomatik kişilerin kitle taraması Korona virüsü (SARS-CoV-2) tükürük kullanarak.

Salgın önleme amacıyla Almanya'da, Saarland topraklarında grup testleri (boyut 5-30).

Lohse, S., Pfuhl, T., Berk-Gttel, B., Rissland, J., Gei-ler, T., Gortner, B., ... - Smola, S. (2020). Test etmek için numuneleri birleştirme Korona virüsü (SARS-CoV-2) asemptomatik kişilerde. Lancet Bulaşıcı Hastalıklar.

Yanlış-negatif havuz testi ve kapalı bir toplumun epidemiyolojik gözetimine başvuru riskini modelleyen makale.

Brault, V., Mallein, B., Rupprecht, J. F. (2020). COVID-19 epidemiyolojik izleme için bir strateji olarak grup testi. arXiv ön baskı arXiv:2005.06776.

Dünya Sağlık Örgütü'nün tavsiyesi.

Dünya Sağlık Örgütü. Tanısal test Korona virüsü (SARS-CoV-2) : geçici rehberlik, 11 Eylül 2020 (No. Who/2019-nCoV/laboratuvar/2020.6). Dünya Sağlık Örgütü.

Viral yükün evriminin ve viral yükün algılama süresi üzerindeki etkisinin modellenmesi Virüs bir grup test stratejisi aracılığıyla. Eğer Virüs tek bir RT-qPCR testi ile ortalama 14 gün saptanabilir, 25 örnekten oluşan bir grup RT-qPCR testinde 11.2 gün boyunca saptanabilir, tespit periyodunun yaklaşık %20'si azalmış, enfeksiyon sonunda %10'u.

Pilcher, C. D., Westreich, D., Hudgens, M. G. (2020). Şiddetli akut solunum sendromu-koronavirüs 2 için grup testi test hızlı ölçeklendirme ve insidansı gerçek zamanlı gözetim sağlamak için. Bulaşıcı Hastalıklar Dergisi, 222(6), 903-909.

Daha fazlası için

Koronavirüs ne kadar süre bulaşıcıdır?

Serolojik testlerin farklı türleri nelerdir?