< Virüs
Coronavirus varyantı nedir Korona virüsü (SARS-CoV-2) ?
Metin güncellendi 2021-01-14
Coronavirus bir varyantı genetik malzeme içinde belirli dizilerin varlığı ile karakterize viral bir suş. Yeni bir varyant baskın hale geldiğinde, araştırmacılar genellikle onu belirlemek için bir ad verir.
Varyant bir form tanımlamak için kullanılan bir terimdir Korona virüsü (SARS-CoV-2) genomunun diziliminde belirli konumlara özgü bir veya daha fazla harfe sahip olan ve ilk formdan farklı olan ancak başka bir koronavirüsten bahsetmek için yeterli olmayan. Aralık 2019'da salgının başlangıcında, coronavirus'un çok az çeşidi vardı. Korona virüsü (SARS-CoV-2) Wuhan'daki ilk hastalardan alınan genomların hepsi birkaç harfle aynıydı. (Soruya bakın Coronavirus mutasyonu nedir Korona virüsü (SARS-CoV-2) ?). Şimdi birkaç bin varyantları vardır Korona virüsü (SARS-CoV-2) mutasyon çizgileri halinde gruplandırılabilir. Bazı türevleri diğerlerinden daha yaygındır. Bu satırları adlandırmak için adlandırma sistemleri önerilmiştir.
Farklı türevlerini nasıl algılarsınız?
Varyantları saptamak için, COVID-19'lu hastalardan alınan koronavirüsler, yani genomlarındaki harflerin belirli dizilerinin belirlenmesi, sıralanması ve ardından genom dizilerinin mutasyonların ortaya çıktığı sırayla ve ne zaman ortaya çıktığı ile karşılaştırılması gerekir (Bkz. önemli varyantlar hakkındaki soruya bakınız, Coronavirus çeşitleri nelerdir Korona virüsü (SARS-CoV-2) bu göz yakaladı?). Büyüteç etkisine dikkat edin: ülkeye bağlı olarak, sıralama farklı bir şekilde yapılır. Birleşik Krallık veya Danimarka gibi bazı ülkeler, enfekte hastaların yaklaşık% 10 örnek almak, ve bu nedenle çok az sıralama (örneklerin sadece% 0,1 Fransa'da sıralanır) (Varyant VoC 202012/01, ayrıca B1.1.7 olarak adlandırılan soruya bakın, ayrıca B1.1.7, Biz İngiliz varyantı hakkında ne biliyoruz?) kullanan Fransa gibi diğer ülkelere göre varyantları keşfetmek için daha olasıdır? Bu nedenle bir varyantın keşfi varyantın varlığına değil, aynı zamanda araştırmasına da bağlıdır!
Kaynaklar
Aralık 2019'da salgının başlangıcında Wuhan'daki ilk hastalardan toplanan genomların hepsi birkaç harfle aynıydı. Nisan 2020 itibariyle, iki koronavirüs genomu arasında ortalama 9.6 mutasyon vardı. Korona virüsü (SARS-CoV-2) tüm bu mevcut rasgele alınır. Bu, salgının Virüs tek bir diziye karşılık gelen ve daha sonra mutasyonlar farklı dallarda zaman içinde birikmiş.
van Dorp, L., Acman, M., Richard, D., Shaw, L.P., Ford, C. E., Ormond, L., ... - Balloux, F. (2020). Genomik çeşitliliğin ve tekrarlayan mutasyonların ortaya çıkması Korona virüsü (SARS-CoV-2) . Enfeksiyon, Genetik ve Evrim, 104351.Temmuz 2020'de 10.022 genomun analizi Korona virüsü (SARS-CoV-2) 68 ülkeden 5775 varyant tespit edilen hastalardan. En yaygın üç varyantı: 3037C > T (proteini değiştirmeyen eşanlamlı mutasyon, 6334 örnek), P4715L (protein 1ab, 6319 örneklerini değiştiren mutasyon) ve D614G (Spike proteinini etkileyen mutasyon, 6294 örnekleri). Altı büyük clades tespit edilmiştir: COVID-19, D614G, L84S, L3606F, D448del ve G392D ilk saptanan olgulara neden olan bazal klade. Clade varyantları bir gruptur. Bir grup varyantı tanımlamak için bir soy olarak da adlandırılır. D614G clade Aralık 2019'dan bu yana en yaygın varyant ı haline gelmiştir.
Koyama, T., Platt, D., Parida, L. (2020). Değişken analizi Korona virüsü (SARS-CoV-2) Genom. Dünya Sağlık Örgütü Bülteni, 98(7), 495.En çok yayın yapan ülkeler Korona virüsü (SARS-CoV-2) Birleşik Krallık (toplam dizilerin %38,9'u) ve Amerika Birleşik Devletleri (tüm dizilerin %22,7'si).
Furuse, Y. (2020). Genomik Sıralama Çabası Korona virüsü (SARS-CoV-2) Pandemi sırasında Ülke tarafından. Uluslararası Bulaşıcı Hastalıklar Dergisi.Şu anda farklı türevleri adlandırma için uluslararası kabul edilen bir konsensüs yöntemi yoktur Korona virüsü (SARS-CoV-2) . Bu makalede, koronavirüsün aktif yayılmasına en çok katkıda bulunan çizgileri tanımlamak için filogenetik çerçeve kullanan rasyonel ve dinamik bir adlandırma sunmudur.
Rambaut, A., Holmes, E.C., O'Toole, V., McCrone, J. T., Ruis, C., ... Pybus, O. G. (2020). Için dinamik bir adlandırma önerisi Korona virüsü (SARS-CoV-2) genomik epidemiyolojiye yardımcı olmak için soylar. Doğa mikrobiyolojisi, 5(11), 1403-1407.