< Tests
COVID-19'u saptamak için örnek nedir: nazofaneal veya oral?
Metin güncellendi 2020-06-03
Oral numuneler, kendi kendine yeten bir koleksiyona izin verdikleri, kontaminasyon açısından daha kolay ve daha az tehlikeli oldukları için tercih edilir. Amerika Birleşik Devletleri, Japonya, İsviçre, Avustralya, İtalya ve İngiltere bunları kullanın.
Nazofaferal örnekleme salgının başlangıcından bu yana kriter olmasına rağmen, birçok ülke oral örnekleme yararlanmıştır, hangi örnekleyici için daha az risk teşkil ve kişisel koruyucu ekipman gerektirmez.
İtalya, Avustralya, Hong Kong, Bangkok, Japonya ve Amerika Birleşik Devletleri'nde (Connecticut ve Kaliforniya'da) yapılan çok sayıda çalışma, coronavirus'un Korona virüsü (SARS-CoV-2) başlangıcından sonra birkaç hafta boyunca oral numunelerde saptanabilir hastalık belirtileri yanı sıra asemptomatik olguların tükürük. Viral RNA'nın akışkanlaştırılması ve çıkarılmasından sonra, viral yük yüksek olduğu ve aynı PCR tekniği kullanıldığından, algılama hassasiyeti nazofarenkgeal numuneler kadar iyidir. Hastanın numuneden 2 saat önce ajeun olması önerilir. Bu koşullar altında, coronavirus genellikle tükürük 4-5 hafta kalır, genellikle burun bezi bulunan daha uzun.
Uygulamada, oral örnekler çeşitli şekillerde alınır:
- tükürmeden tükürük toplayan bir pipet kullanarak,
- tükürmeden önce tükürük birkaç dakika ağızda tutulur,
- bir çözelti ile bir ağız durulayın,
- tükürük tükürük elde etmek için tükürmeden önce bir boğaz kazıma.
Tükürükler tespit en güvenilir gibi görünüyor Korona virüsü (SARS-CoV-2) , ancak sistematik karşılaştırmalı çalışmalar yapılması gerekmektedir. Verilen bu Korona virüsü (SARS-CoV-2) solunum yollarında, tükürük balgam oral ve bronşiyal sıvıların aynı örnekte toplanmasına izin vererek koronavirüs saptanma şansını artırır.
Oral örneklerin nazofarenk örneklere göre pratik avantajları vardır:
(1) Tükürük veya balgam almak çok kolaydır. Bu örnek, çocuklar da dahil olmak üzere, diğer insanları coronavirus'a maruz bırakmadan test edilenlere verilebilir. Aksine, nazofalet alçalımı hassas ve invaziv, ağrı ya da gen neden olabilir. Genellikle hapşırma veya öksürük neden olur, hangi kontaminasyon önemli bir risk alarak kişi ortaya çıkarır, ve kendilerini korumak için onları zorlar. Nazofaneal numuneyi birkaç kez önermek zordur.
•2) tükürük örneklemesi özel ekipman gerektirmez. Nazofavergeal (bezler) ve örnekleyici koruması (bluz, FFP2 maskesi, eldiven, charlotte) maddesi büyük ölçekli testler in sınırlayıcı bir faktördür.
Son zamanlarda yapılan bazı kalite çalışmaları, tükürükte asemptomatik ve semptomatik olgular arasında nazofaleal örnekleme kadar viral yükün önemli olduğunu ve asemptomatik lerde saptanan hastalığın burun bezleri kadar iyi olduğunu göstermektedir. Kolay, güvenli ve daha az invaziv tarama testi için: tükürük için tercih!
Kaynaklar
Hong Kong'da hastaların kendileri tarafından toplanan tükürükte çok sayıda viral partikül bulunur. Bu sayı hastalığın seyri sırasında azalır, daha sonra ilk 8-10 gün sonra iptal hastalık belirtileri . 23 hastadan 3'ünün tükürükte negatif olduğu saptandı. Bu çalışmada PCR testi bir ev yapımı test ve tükürük boğazını kazıma ve öksürük sonra sabah toplanan.
Için, K. K. W., Tsang, O. T. Y., Yip, C.C. Y., Chan, K. H., Wu, T.C., Chan, J.M.C., ... - Akciğer, D.C. (2020). Tükürükte 2019 roman koronavirüsünün tutarlı tespiti. Klinik Enfeksiyon Hastalıkları.Melbourne'de 622 hastanın 39'u nazofarenkgeal örneklerde (PNP) pozitif, 33'ü tükürük pozitifti. 50 negatif PNP arasında tükürükte pozitif olduğu belirtiliyor. Bu çalışmada hastalar tükürüklerini 1-2 dakika bekletip 1-2 mL tükürdüler. tespit edildi Virüs Korona virüsü (SARS-CoV-2) PNP testi pozitif çıkan hastaların %85'i. Tespit edilen RN miktarı burun örneklemesinden daha az tükürükteydi. Ancak, tam olarak aynı şekilde yapılamayan PCR sonuçları doğrudan karşılaştırılamaz. Özellikle, tükürük viral RNA ayıklanır önce bir sıvılaşma tampon seyreltilmiş olmalıdır. Ve bu gibi çoğu çalışmada yazarlar bir örnekleme kontrolü (örnek toplanan insan hücrelerinin miktarını bilmek sağlayan PCR tarafından ölçülen bir insan geni) ile sonuçlarını normalleştirmek yok.
Williams, E., Bond, K., Zhang, B., Putland, M., Williamson, D.A. (2020). Algılama için non-invaziv bir örnek olarak tükürük Korona virüsü (SARS-CoV-2) . Klinik Mikrobiyoloji DergisiVarese Yoğun Bakım Ünitesi'nin (İtalya) Covid-19'daki 25 kritik hastadan oluşan tükürük, Virüs Korona virüsü (SARS-CoV-2) . Bu çalışmada hastanın ağzına yerleştirilen bir pipet ile tükürük kurtarıldı. Hastaların iki tükürük için pozitif, ama PNP değil, bu nedenle daha az hassas bir test gibi görünüyor. Bu İtalyan grup tarafından yapılan yeni bir çalışma tükürük için pozitif ama PNP negatif diğer iki hasta doğruladı.
Azzi, L., Carcano, G., Gianfagna, F., Grossi, P., Dalla Gasperina, D., Genoni, A., Maurino, V. (2020). Tükürük algılamak için güvenilir bir araçtır Korona virüsü (SARS-CoV-2) . Enfeksiyon Dergisi.RT-PCR tükürük testinin duyarlılığı ve özgüllüğü Bangkok'taki bir hastanede ki 200 hastada pnp testini referans olarak kullanarak sırasıyla %84 ve %99 idi. Bu çalışmada, oral örnekleme zorla öksürük sonrası kurtarılır.
Pasomsub, E., Watcharananan, S. P., Boonyawat, K., Janchompoo, P., Wongtabtim, G., Suksuwan, W., ... - Phuphuakrat, A. (2020). Koronavirüs hastalığı tanısıiçin non-invaziv bir örnek olarak tükürük örneği-2019 (COVID-19): kesitsel bir çalışma. Klinik Mikrobiyoloji ve Enfeksiyon.Kaliforniya'da bir grup hastada (88) ve hastaneye yatışmayan iyileşme (24) tükürük testinin duyarlılığı PNP testiile karşılaştırıldı. 88 hastanın %98'i PNP'de, %69'u tükürükte pozitifti. 24 iyileşme sentinden 4'ü tükürük ve PNP pozitif, 5'i PNP'de pozitif, tükürükte negatif ve 1'i ise başka bir yol. Bu çalışmanın sınırlamaları arasında hastalarla ilgili klinik verilerin eksikliği, testlerin 3 noktada yapılması ve tükürük iki farklı kitten toplanmış olması yer almaktadır. Lu, J., Becker, D., Sandoval, E., Amin, A., De Hoff, P., Leonetti, N., ... - Grzymski, J. (2020). Tükürük topluluk ortamında COVID-19 tespiti için nazofanetgeal bezler daha az duyarlıdır. medRxiv.
Lu, J., Becker, D., Sandoval, E., Amin, A., De Hoff, P., Leonetti, N., ... - Grzymski, J. (2020). Tükürük topluluk ortamında COVID-19 tespiti için nazofanetgeal bezler daha az duyarlıdır. medRxiv.76 denekte (10 hasta ve 66 şüpheli) tükürük bir tüpten toplanmış ve Virüs PCR tarafından algılanır. 10 hastanın 8'i PNP ve tükürük pozitif, 1'i PNP pozitif, tükürükte negatif ve son olarak da başka bir yol saptandı.
Iwasaki, S., Fujisawa, S., Nakakubo, S., Kamada, K., Yamashita, Y., Fukumoto, T., ... - Hayasaka, K. (2020). Karşılaştırma Korona virüsü (SARS-CoV-2) nazofafer algı ve tükürük tespiti. medRxiv.Tespiti üzerine bir düzine makalenin bir meta-analizi Korona virüsü (SARS-CoV-2) tükürük, ekstraksiyon yöntemleri, çeşitli kitleri ve numunelerin kalitesi ile PCR verilen varyasyonlar verilen karşılaştırma zorluk vurgulayarak: ya tükürük, balgam veya orofarenk yiyici örnekleri.
Santosh, T. S., Parmar, R., Anand, H., Srikanth, K., Saritha, M. (2020). Tükürük tanıları ve Covid-19'un saptanmasındaki potansiyel tutulumu gözden geçiriliyor. Cureus, 12(4).Los Angeles'ta start-up CURATIVE Gıda ve İlaç İdaresi (FDA) oral sıvılar üzerinde 24 saatlik testler için onay aldı, haftada bir milyon testleri hedefleyen. Bu test İngiltere'de de kullanılmalıdır. Gıda ve İlaç İdaresi (FDA) zaten ilk onaylamıştı Korona virüsü (SARS-CoV-2) New Jersey Rutgers Üniversitesi tarafından geliştirilen tükürük örnekleri. Özel bir kit birkaç kez tükürür ve daha sonra daha sonra PcRs yürüten Rutgers Klinik Genomik Laboratuvarı'na 48 saat içinde geri gönderir hastaya gönderilir.
Başlangıç Tedavi.Fransa'da, SKILLCELL konsorsiyumu, CNRS SYS2DIAG laboratuvarı ve VOGO EasyCov, Haziran ayında Fransa ve Avrupa'da ticarileştirme için bir tükürük tarama testi sanayileşme duyurdu. Bir saatten az bir sürede! Test reaktiflerle karıştırılan tükürük üzerinde yapılır ve 65oC'de 30 dakika kuluçkaya yatırılır.
Helgouach, N, Champigneux, P, Santos Schneider, F, Molina, L, Espeut, J, Alali, M, Baptiste, J, Cardeur, L, Dubuc, B, Foulongne, V, Galtier, F, Makinson, A, Marin, G, Picot, MC, Prieux-Lejeune, A, Quenot, M, Robles, FC, Salvetat, N, Vetter, D, Reynes, J, Molina, FCOCo.Bu çalışma, tanı gününde aynı anda toplanan 145 numunede ve 2-7 gün sonra tükürük ve nazofarenker örneklerin karşılaştırılmasını erteler. 145 örnekte tükürük pozitif, 19'u nazofarenk gealiyal için pozitifti. Bu COVID-19 örneklerinde tükürük, tek başına alması çok kolay ve en azından nazofarenkgeal numune kadar hassas bir mukus olarak ortaya çıkar. Korona virüsü (SARS-CoV-2) .
Byrne, RL, Kay, GA, Kontogianni, K, Brown, L, Collins,, Cuevas, LE, Ferreira, D, Fraser, AJ, Garrod, G, Hill, H, Menzies, S, Mitsi, E, Owen, SI, Williams, CT, Hyder-Wright, A, Adams, ER, Küba-Atienzar, AI. Tükürük için üst solunum bezleri için hassas, spesifik ve non-invaziv bir alternatif sunuyor Korona virüsü (SARS-CoV-2) Tanı. MedRxiv, 11 Temmuz 2020.Almanya'da yardım grupları tarafından yayınlanan ilk çalışmalardan biri PNP ve tükürme sonuçlarının çok benzer olduğunu göstermektedir (7 hasta hastalık belirtileri ). Unutmayın ki Virüs sona erdikten sonra tükürük kalır hastalık belirtileri ve bu coronavirus dışkıda bulaşıcı bulunamadı. Tespit Virüs tükürük ve solunum salgıları tükürük ve solunum daha uzun sürebilir hastalık belirtileri :
Welfel, R, Corman, VM, Guggemos, W, Seilmaier, M, Zange, S, Muller, MA, Niemeyer, D, Jones, TC, Vollmar, P, Rothe, C, Hoelscher, M, Bleicker, T, Brunnink, S, Schneider, J, Ehmann, R, Zwirgier, K, Droslma, C, Wendtner, C. Virolojik değerlendirme COVID ile hastaların. Doğa cilt 581, sayfa 465-469 (2020).Tespiti üzerine bir düzine makalenin bir meta-analizi Korona virüsü (SARS-CoV-2) tükürük, ekstraksiyon yöntemleri, çeşitli kitleri ve numunelerin kalitesi ile PCR verilen varyasyonlar verilen karşılaştırma zorluk vurgulayarak: ya tükürük, balgam veya orofarenk yiyici örnekleri.
Santosh, T. S., Parmar, R., Anand, H., Srikanth, K., Saritha, M. (2020). Tükürük tanıları ve Covid-19'un saptanmasındaki potansiyel tutulumu gözden geçiriliyor. Cureus, 12(4).Los Angeles'ta start-up CURATIVE Gıda ve İlaç İdaresi (FDA) oral sıvılar üzerinde 24 saatlik testler için onay aldı, haftada bir milyon testleri hedefleyen. Bu test İngiltere'de de kullanılmalıdır. Gıda ve İlaç İdaresi (FDA) zaten ilk onaylamıştı Korona virüsü (SARS-CoV-2) New Jersey Rutgers Üniversitesi tarafından geliştirilen tükürük örnekleri.
Özel bir kit birkaç kez tükürür ve daha sonra daha sonra PcRs yürüten Rutgers Klinik Genomik Laboratuvarı'na 48 saat içinde geri gönderir hastaya gönderilir.Tükürük ön işlemden sonra RT-LAMP kullanan EasyCOV algılama kiti, Korona virüsü (SARS-CoV-2) 220 kişi ile yapılan ilk çalışmaya göre 40 dakika %87.5 hassasiyetle.
Çalışma sonunda toplam 720 kişinin entegre edilmesi bekleniyor.Yale Üniversitesi'ndeki araştırmacılar tükürük testlerinin nazofarenkeal örneklerde (n -70 COVID hastaları) yapılanlardan daha hassas olduğunu göstermektedir:
Wyllie, A. L., Fournier, J., Casanovas-Massana, A., Campbell, M., Tokuyama, M., Vijayakumar, P., ... - Petrone, M. E. (2020). Tükürük için daha duyarlıdır Korona virüsü (SARS-CoV-2) nazofanetgeal bezlere göre COVID-19 hastalarında saptanabilir. New England Journal of Exp. Medicine, 24 Eylül 2020, 383: 1283-1286.Bu, Virüs oda sıcaklığında bir haftadan fazla tükürük, 4 santigrat derecede 2 haftadan fazla ve -80 santigrat derecede dondurucuda ay boyunca stabildir. Bu gözlemler basit ve ucuz bir toplama sisteminin mümkün olduğunu göstermektedir:
Ott, IM, Strine, MS, Watkins, AE, Boot, M, Kalinich, CC, Harden, CA, Vogels, CBF, Casanovas-Massana, A, Moore, AJ, Muenker, MC, Nakahata, M, Tokuyama, M, Nelson, A, Fournier, J, Bermejo, S, Campbell, M, Datta, R, Dela Cruz, CS, Farhadian, SF, Ko, AI, Iwasaki, A, Grubaugh, ND, Wilen, CB, WYill, Korona virüsü (SARS-CoV-2) algılama pahalı toplama aygıtları için ihtiyaç yok eder.Fransız CoVISAL çalışma kötü açıklanan koşullarda Fransız Guyanası Amazon yağmur ormanlarında yürütülen laboratuvar koşulları (Yale Üniversitesi, Hokkaido Üniversitesi) ve alanında alınan gruplar arasında varyasyonları ortaya koymaktadır. 25 asemptomatik olguya dayanan bu çalışma birçok uluslararası çalışmayla çelişmektedir. Ancak, Eylül 2020 sonunda Yüksek Sağlık Kurumu sadece kişiler üzerinde tükürük testleri yürütmek için açtı hastalık belirtileri .
Nacher, M, Mergeay-Fabre, M, Blanchet, D, Benois, O, Pozl, T, Mesphoule, P, Sainte-Rose, V, Vialette, V, Toulet, B, Moua, A, Simon, S, Guidarelli, M, Galindo, M, Biche, B, Faurous, W, Abad, F, Fahrasmane, A, Rochemont, D, Vignier, N, Vabret, A, Demar, M. COVISAL Guyana, Nacher, M, Demar, M. Toplu tarama için aliva ve nasopharyngegea örnekleme için muhtemel karşılaştırmaBir evde numunelerin birleştirilmesi, popülasyondaki enfekte salgınların tespitini optimize edebilir:
Hogan, C.A., Sahoo, M. K., Pinsky, B.A. (2020). Topluluk İletimini Tespit Etme Stratejisi Olarak Örnek Havuzlama Korona virüsü (SARS-CoV-2) . Jama, ne oldu?Yakın zamanda yapılan bir çalışmada, 55 asemptomatik COVID vakasıile tükürük tespit etmek için yüksek performanslı bir örnekleme yöntemi olduğunu göstermektedir Korona virüsü (SARS-CoV-2) asemptomatik hastalarda dahil:
Tükürük örneklemesi için %92 duyarlılık, nazofatüral örneklemede %86, eşleşme olasılığı %99.8'dir. Testler havaalanlarıyla temas eden veya gelen 1950'den fazla kişi üzerinde gerçekleştirildi: Yokota, I, Shane, P, Okada, K, Unoki, Y, Yang Y, Tasuku, I, Sakamaki, K, Iwasaki, S, Hayasaka, K, Sugita, J, Nishida, M, Fujisawa, S, Teshima, T. (2020). Asemptomatik kişilerin kitle taraması Korona virüsü (SARS-CoV-2) tükürük kullanarak. 10.1101/2020.08.13.20174078.Farklı RT-qPCR sistemleri ve RT-LAMP sistemini karşılaştıran 103 pozitif olgu üzerinde yapılan bir Japon çalışması, RT-qPCR'Nin daha hassas olduğu sonucuna vardı.
Ikeda, M, Imai, K, Tabata, S, Miyoshi, K, Mizuno, T, Murahara, N, Horiuchi, M, Kato, K, Imoto, Y, Iwata, M, Mimura, S, Ito, T-Tamura, K, Kato, Y. (2020). RT-qPCR, direkt RT-qPCR, RT-LAMP ve COVID-19 tanısı için hızlı bir antijen testi ile kendi kendine toplanan tükürük klinik değerlendirilmesi. 10.1101/2020.06.06.20124123.Tükürük örneklerinde 5 ile 20 arasında gruplandırılan testler, SalivaDirect testinin arkasında da Yale Üniversitesi ekibi tarafından:
Watkins, A. E., Fenichel, E. P., Weinberger, D.M., Vogels, C.B., Brackney, D. E., Casanovas-Massana, A., ... - Cruz, C. S. D. (2020). Tükürük havuzu artırmak için Korona virüsü (SARS-CoV-2) kapasiteyi test etmek. medRxiv.Urbana Champaign Üniversitesi 2020 yazından bu yana tüm personeli için havuzlama tükürük testleri geliştirmektedir ve 14 Kasım 2020 itibariyle RT-qPCR ile 800.000'den fazla tükürük testi gerçekleştirmiştir. Havuz pozitifse, havuzdaki her kişi için PCR testi yapılır.
Ranoa, DR, Hollanda, RL, Alnaji, FG, Yeşil, KJ, Wang, L, Brooke, CB, Burke, MD, Fan, TM, Hergenrother, PJ. Tükürük Bazlı Moleküler Test Korona virüsü (SARS-CoV-2) RNA Çıkarma atlar. https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.06.18.159434v1Amerika Birleşik Devletleri'ndeki Duke kampüsünde bir izleme programı, öğrencilerin tükürükleri ile test edilerek keşfedildi ve bunların %50'si bazen yüksek viral yüke sahip asemptomatikti.
Denny TN, Andrews L, Bonsignori M, ve diğerleri. Asemptomatik Havuzlu Gözetim Test Programı Nın Uygulanması Korona virüsü (SARS-CoV-2) Bir Kolej Kampüsünde Enfeksiyonlar — Duke Üniversitesi, Durham, North Carolina, 2 Ağustos-11 Ekim 2020. MMWR Morb Mortal Wkly Temsilcisi. ePub: 17 Kasım 2020. DOI: http://dx.doi.org/10.15585/mmwr.mm6946e1external simgesi