< Tests

Grup testlerinde yanlış negatiflerin riskleri nelerdir?

Metin güncellendi 2020-10-15


Diğer örneklerle karıştırılmış, az içeren bir örnek Virüs pozitif olarak saptanmayabilir ve bu bireysel bir tanı problemi oluşturabilir. Bu riske rağmen (sözde yanlış negatif), havuzlama testleri şu anda abd, Birleşik Krallık ve Belçika'daki birçok üniversite kampüsünde salgının yayılmasını kontrol altına almak için kullanılmaktadır.

Bir test negatif olduğunda, Virüs Yanlış-negatiften bahsediyoruz. Grup testlerinin prensibi, 100 numuneyi test etmek yerine, 10'dan oluşan 10 gruba (havuz) gruplandırılabilen ve her grubu tek bir testle test edilebilen dir. Gruplama testleri ("havuzlama": neden ve ne için?

İdeal olarak, bir grup negatifse, onu oluşturan her örnek de negatif olmalıdır. Ancak, gruplandırma, numunenin veya numunelerin seyreltilmesine neden olur. Virüs içermeyenler. Bu seyreltme daha sonra yanlış negatifler oluşturmak olasıdır: havuzda viral konsantrasyon tanı makinesinin algılama eşiği altında olabilir. Bu durumda, grup testinin sonucu aslında grupta enfekte bir kişi olduğunda negatif (enfeksiyon yok).

Konsantrasyon Virüs Korona virüsü (SARS-CoV-2) bir nazofatür veya tükürük örneğinde 2 enfekte birey arasında x10.000.000'den büyük bir faktöre göre değişiklik gösterebilir. Nitekim, RT-qPCR testinin sonucu genellikle iki katına çevrim (Ct denir, Döngü eşik için) şeklinde ifade edilir: 25 katlama döngüsü en yüksek konsantrasyona sahip örnekleri ayırabilirsiniz Virüs konsantrasyonu RT-qPCR test algılama sınırına yakın olanlar (225-107).

Bu çok büyük dağılım etkisini tam olarak anlamak için, aşağıdaki zenginliğin dağılımına sahip bir toplum hayal edin. Sözde "negatif" nüfus 0 veya daha az 1 $ kendi cebinde. "Pozitif" nüfus, bir en az zengin nüfusun% 5, ceplerinde, bir servet 1 $ ve 2 $ arasında tahmin hayal; sonraki% 5 zengin, 2 $ ve 4 $ arasında bir servet; sonraki% 5 en zengin, 4 $ ve 8 $ arasında, ve benzeri. Pozitif nüfusun %50'si 1.000 dolar; ve en zengin% 5 için, gerçek bir yıllık: 500.000 $ ve 1.000.000 $ arasında. Bu şirkette olumlu bireylerin% 80 daha sonra fazla 16 $ bir servete sahip olacak. Hatta 15 kişilik bir havuzda seyreltilmiş, birey başına zenginlik 1 üzerinde kalacaktır.

Konsantrasyon Virüs farklı örneklerde (enfeksiyonun farklı aşamalarında farklı bireylerden) aynı şekilde dağıtılır: 1 $ sonra zenginlik Virüs rt-qPCR cihazında algılama. Enfekte popülasyonun ihmal edilemeyen bir fraksiyonu (toplam pozitif popülasyonun %5-15'i aralığında) Virüs tıbbi laboratuvarların RT-qPCR tespit limitlerine yakındır. Bu nedenle, bu düşük pozitif bireyler, 5'ten büyük kümelenmiş bir testte algılanmama olasılığı yüksektir. Ancak, kümelenmiş testler, örnekleri geleneksel RT-qPCR makinesinin algılama eşiğinin çok üzerinde viral bir konsantrasyon taşıyacak enfekte popülasyonun çok büyük bir bölümünü (genellikle 16 kişilik bir grup için %80'den fazla) tespit etmede etkili olmaya devam etmektedir.

Pozitif bir bireyden alınan numunenin düşük konsantrasyona sahip olabileceği iki kez vardır. Virüs bulaşıcı dönemin başında ve sonunda. Gerçekten de, kontaminasyon dan sonra, konsantrasyon Virüs birkaç gün için tespit edilemez kalır, daha sonra potansiyel başlangıcından önce yaklaşık bir gün zirveye kadar hızla yükselir hastalık belirtileri , daha sonra kontaminasyon dan sonra birkaç gün birkaç gün algılama sınırlarının altına düşer. Bir insan ne kadar bulaşıcıdır?

Bireysel veya grup, bir test bir kuluçka döneminde bir birey tespit etmez bir salgın risk yönetimi sorunu oluşturabilir: kişi o sağlıklı olduğunu düşünebilirsiniz ve önümüzdeki günlerde bulaşıcı olacaktır. Bu nedenle daha az hassas bir grup testi, enfeksiyöz fazın başında bir bireyi tespit etmeme olasılığı daha yüksektir.

Öte yandan, enfeksiyon sonunda bireylerin daha az tespiti, enfeksiyonun sonunda bireylerin çok az kirletici olması muhtemeldir, çünkü salgını kontrol açısından potansiyel olarak daha az sorunlu. Ben hiç COVID-19 vardı görmek için testler nelerdir sorusunu görün?

Modelleme çalışmaları havuzla ilgili yanlış negatiflerin esas olarak enfeksiyon sonundabireyleri kapsadığını göstermektedir. Gerçekten de, viral konsantrasyonartış dönemi enfeksiyon sonu dönemine göre çok kısadır.

Seyreltmenin neden olduğu hassasiyet kaybını telafi etmek için iki strateji konulabilir:

Varlığını tespit etmek için antijenik testler Virüs gruplanmış testler için tamamlayıcı bir çözüm temsil. Bu antijenik testler özellikle yüksek viral konsantrasyonları olan bireylerin saptanabilir için uygundur. Ancak, duyarlılıkları değişkendir ve RT-qPCR testlerinden daha düşüktür ve tek tek RT-qPCR test algılama sınırından 100 ila 1000 kat daha büyük bir algılama eşiği vardır. Bu tahmine göre, bireysel bir antijenik testte yanlış negatiflik riski daha sonra 100-1000 kişiden oluşan bir grup testi ile karşılaştırılabilir olacaktır.

Sonuç olarak, havuzlama veya havuzlama, büyük bir popülasyonun daha sık test edilmesine olanak tanır. Bazı yanlış-negatif risklerin varlığına rağmen, havuzlama zaten Singapur, Almanya, Uruguay, İsrail ve Portekiz'de sağlık çalışanları ekran için AMERIKA Birleşik Devletleri, Belçika ve İngiltere'de birçok üniversite kampüslerinde kullanılır.


Facebook Twitter Linkedın

Kaynaklar

Mükemmel bir test durumunda en uygun boyutu gösteren tarihsel makale (havuzda grubun büyüklüğü ile yanlış negatif riskini artırmadan).

Dorfman, R. (1943). Büyük popülasyonların kusurlu üyelerinin tespiti. Matematiksel İstatistik Yıllıkları, 14(4), 436-440.

Konsantrasyonun tahmini dağılımı Virüs Korona virüsü (SARS-CoV-2) 6 Haziran 2020'den önce Berlin, Almanya'daki Charity Hastanesi'nde farklı yaş grupları için oral veya nazofarenkgeal örneklerde.

Jones, T.C., Mhlemann, B., Veith, T., Biele, G., Zuchowski, M., Hoffmann, J., ... - Drosten, C. (2020). Bir analiz Korona virüsü (SARS-CoV-2) hasta yaşına göre viral yük. medRxiv.

Amerika Birleşik Devletleri'nde huzurevleri nüfusun büyük bir örnek gözlenen viral yüklerin dağılımı. Semptomatik ve asemptomatik bireylerde ölçülen viral yükler benzerdir.

Lennon, N. J., Bhattacharyya, R. P., Mina, M. J., Rehm, H. L., Hung, D. T., Smole, S., ... - Gabriel, S.B. (2020). 32.480 sakinleri ve huzurevleri ve Massachusetts yardımlı yaşam tesisleri personeli arasında COVID-19 test sırasında veya semptomları olmayan bireylerde viral düzeylerin karşılaştırılması. medRxiv.

SARS-Cov2'nin tespiti için havuz testinde yanlış negatif riskinin modellanması. Kapalı bir topluluğun epidemiyolojik gözetimi için yaygınlık ölçümü (havuzlarda pozitif olgular belirlenmeden) için uygulama, ehpad tipi. Yaygınlık, yani bir toplumda pozitif bireylerin oranı, havuzlarda olumlu vakalar belirlenmese bile büyük bir doğrulukla tahmin edilebilir.

Brault, V., Mallein, B., Rupprecht, J. F. (14 Mayıs 2020). COVID-19 epidemiyolojik izleme için bir strateji olarak grup testi. arXiv ön baskı arXiv:2005.06776.

Sars-Cov2 enfeksiyonu sırasında kapalı bir topluluğun epidemiyolojik gözetimine uygulama sırasında kümelenmiş testlerin duyarlılığındaki değişikliklerin etkisi üzerine modelleme makalesi. Havuz hassasiyetinin kaybı esas olarak enfeksiyon sonunda örneklenmiş bireylere atfedilir. Yaygınlık, yani bir toplumda pozitif bireylerin oranı, havuzlarda olumlu vakalar belirlenmese bile büyük bir doğrulukla tahmin edilebilir.

Cleary, B., Hay, J. A., Blumenstiel, B., Gabriel, S., Regev, A., Mina, M. J. (6 Ekim 2020). Kaynak kısıtlı ayarlarında havuzlu testleri optimize etmek için viral yük ve salgın dinamikleri kullanmak, medRxiv.

Varlığı belirlemek için yeteneğin bir değerlendirme Korona virüsü (SARS-CoV-2) çok ağır seyreltilmiş örneklerde. Bir konsantrasyon örneği Virüs oldukça ortalama 49 negatif örnek (10 üzerinden 10) çeşitli havuzlarda yanı sıra 499 negatifbir havuzda tespit edilebilir kalır.

Gan, Y., Du, L., Damola, F.O., Huang, J., Xiao, G., Lyu, X. (2020). Bir Strateji Olarak Örnek Havuzlama Korona virüsü (SARS-CoV-2) Nükleik Asit Taraması Yanlış Negatif Oranını Arttırır. medRxiv

Viral algılama sağlayan bir dijital damlacık PCR (ddPCR) tekniğinin uygulanması Korona virüsü (SARS-CoV-2) düşük konsantrasyonlu pozitif bir örnek Virüs 15 negatif örnekiçeren bir gruba dahil edilmiştir.

Martin, A., Storto, A., Andre, B., Mallory, A., Dangla, R., Visseaux, B., Gossner, O. (2020). Dijital PCR ile yüksek hassasiyetli COVID-19 grup testi. arXiv ön baskı arXiv:2006.02908.

Tükürük örneklerinde Yale Üniversitesi ekibi tarafından gruplanmış testler (boyut 5-20), yine SalivaDirect testinin arkasında.

Watkins, A. E., Fenichel, E. P., Weinberger, D.M., Vogels, C.B., Brackney, D. E., Casanovas-Massana, A., ... - Cruz, C. S. D. (2020). Tükürük havuzu artırmak için Korona virüsü (SARS-CoV-2) kapasiteyi test etmek. medRxiv.

Viral algılama limitinin viral konsantrasyonu gerekçe göstererek daha düşük bir duyarlılığa rağmen antijenik testlerin değerinin tartışılması, antijenik testlerde bireysel RT-qPCR testinden 100 ila 1000 kat daha yüksek.

Mina, M. J., Parker, R., Larremore, D.B. (30 Eylül 2020). COVID-19 test hassasiyetini yeniden düşünmek—Çevreleme stratejisi. New England Tıp Dergisi.

Kültürdeki hücrelere bulaşabilme yeteneği yle tahmin edilen iletim potansiyeli, numuneleri yüksek konsantrasyona sahip kişilerle sınırlı görünüyor. Virüs .

Rhee, C., Kanjilal, S., Baker, M., Klompas, M. (2020). Süresi Korona virüsü (SARS-CoV-2) Enfekte: Yalıtımı Durdurmak Ne Zaman Güvenlidir?. Klinik Enfeksiyon Hastalıkları.

İngiltere'deki üniversitelerde havuz testinin durumunun tartışılması. SAGE Bilimsel Konseyi, öğrencilerin ve üniversite personelinin düzenli testlere tabi tutulmasını önerir.

Mahase, E. (2020). Covid-19: Üniversiteler kampüsleri açık tutmak için öğrencilerin havuzlu testlerini tamamlarlar.

Daha fazlası için

Testleri gruplandırma ("havuzlama" veya havuzlama): neden ve ne için?

Yanlış pozitifler, yanlış negatifler, duyarlılık, COVID testlerinin özgüllüğü: neden bahsediyoruz?

Hangi yaklaşımlar büyük ölçekli taramayı hızlandırabilir?

Ben ile enfekte olup olmadığını temel testi nedir Korona virüsü (SARS-CoV-2) ?